애플은 신규 앱 스토어가 은행에 100만 유로(약 14억 원)를 보유하고 있어야 하며, 예치금이 이 수치 아래로 떨어지면 폐업될 수 있다고 주장했다. 또한 애플은 신규 앱 스토어에 100만 다운로드 이후 다운로드 건당 50센트(약 600원)를 자동으로 청구한다.

100만 건 이상 다운로드 된 개별 앱에도 50센트 요금이 적용돼, 애플은 앱 개발자가 다른 스토어에 앱을 등록할 경우 애플에 지불해야 할 금액을 추정할 수 있는 웹사이트를 만들었다. 다운로드 수치가 백만 건을 돌파하면 지불해야 하는 금액이 수천 달러에 달할 수 있지만, 애플 앱스토어에서만 독점적으로 판매하면 비용이 들지 않는다.

또한 애플은 앱스토어에서뿐만 아니라 다른 곳에서 판매되는 앱의 매출에 대해 17% 수수료를 부과해 비판을 받고 있다.