긴급히 내놓는 만큼 완전히 대응이 이뤄진 AGESA 1.0.0.7 버전이 아닌 상당수가 AGESA 1.0.0.6 버전에 기반한 '베타' 버전이었고, 이중 ASUS의 베타 바이오스 다운로드 주의 사항에 해당 버전 적용시 메인보드의 보증 정책이 무효화된다는 것으로 해석되는 내용이 포함되어 있어 논란이 되었다.

이에 ASUS는 보도자료를 통해 AM5 메인보드의 베타 및 정식 바이오스 모두 원래 보증이 적용된다며, 베타 바이오스 적용시 제품 보증이 무효화된다는 우려를 불식시켰다. 실제로 베타 바이오스의 메인보드 보증 유지 내용을 발표한 이후 이슈가 되었던 보증 무효화 관련 내용의 주석은 삭제되었다. 하지만 이와 관련해 논란을 자초했다는 비판은 피하기 어려울 것이다.