삼성페이가 받겠다는 수수료는 결제 건당 0.15%로, 애플페이와 똑같은 수준이다. 카드사들은 삼성페이 수수료와 관련해 별다른 입장을 내놓고 있지 않다. 관건은 얼마나 많은 카드사가 삼성페이의 수수료 제안을 수용할지다. 

만약 카드사들이 삼성페이에 수수료를 내겠다고 하면 수익에 타격을 입을 것으로 보인다. 애플페이 대비 삼성페이 사용률이 압도적으로 높은 가운데, 갈수록 수수료율 인하가 이뤄지고 있어 카드사의 수익이 악화되고 있기 때문이다. 또 이렇게 될 경우 비용이 소비자에게까지 전가되는 문제가 생긴다.